如何安装FreeSurfer
2025-04-24阅读 1 分钟73
必要条件
Window系统推荐使用WSL2子系统运行Ubuntu22来作为安装环境
Mac M系列可以直接下载安装包直接安装
Windows安装
FreeSurfer安装包下载https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/rel7downloads
1、打开ubuntu22
在命令行输入
wget https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/dist/freesurfer/8.0.0/freesurfer_ubuntu22-8.0.0_amd64.deb
# 安装相关依赖
sudo apt update
sudo apt-get install -f
sudo dpkg -i freesurfer_ubuntu22-8.0.0_amd64.deb
2、编辑~/.bashrc
在命令行输入
sudo nano ~/.bashrc
# 添加下面变量
export DISPLAY=:0
export FREESURFER_HOME=/usr/local/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
需要注意freesurfer的路径可能是**/usr/local/版本/freesurfer**
3、申请freesurfer证书
申请地址
打开命令行
cd $FREESURFER_HOME
sudo nano license.txt
# 将申请的key复制到这个文件里面
xxxxx@qq.com
84126
*CGo3bXjJf4HI
FS69mP8wOzvU
aPtLNDen1zQppTGYLu2KfqT27+oL7QHizDzkDFAgHM
4、启动freesurfer
打开命令行输入
freeview
快速安装
可以使用我配置的好并安装好freesurfer的ubuntu22系统，开箱即用
1、在window打开终端
wsl --import Ubuntu-22.04 d:\Ubuntu-22.04 d:\Ubuntu-22.04.tar
# 第一个参数name 第二个安装位置，第三个系统安装包的位置
2、启动xluanch
3、启动freesurfer
在window打开终端输入
wsl
freeview