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1、将下载好的 scientific-agent-skills 压缩包解压到本地;
2、开解压后的文件夹,复制文件夹的完整路径;
3、打开 AI Agent,把路径粘贴给它,并明确告知需要安装哪个技能;
4、⚠️ 注意:请按需单个安装,不要一次性安装全部 163 个技能——技能过多会占用大量上下文窗口,导致对话超载、AI 响应变慢甚至无法正常工作。
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| scanpy | 单细胞 RNA-seq 标准分析流水线:QC、归一化、PCA/UMAP/t-SNE 降维、聚类、差异表达、可视化;可把 Seurat/RDS 转成 h5ad |
| anndata | 单细胞注释矩阵数据结构(.h5ad),scverse 生态的数据格式底座 |
| scvi-tools | 单细胞多组学深度生成模型:概率批次校正(scVI)、迁移学习、带不确定性的差异表达、多模态整合(TOTALVI/MultiVI) |
| scvelo | RNA velocity 分析:由未剪接/剪接 mRNA 动力学推断细胞状态转换方向、潜在时间、驱动基因 |
| arboreto | 基因调控网络(GRN)推断:GRNBoost2、GENIE3,支持分布式大规模计算 |
| biopython | 生物计算综合工具库:39 个 NCBI 子库访问、序列分析、结构生物学工具 |
| pysam | HTSlib 基因组文件处理:SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ、pileup、coverage、索引 |
| scikit-bio | 生物学数据工具包:序列分析、比对、系统发育树、α/β多样性、UniFrac、PCoA、PERMANOVA(微生物组常用) |
| bioservices | 约 40 个生物数据库的 Python 程序化访问入口 |
| gget | 快速查询 20+ 生物数据库:基因信息、BLAST/BLAT、病毒序列、AlphaFold 结构、富集分析、OpenTargets、COSMIC、CELLxGENE |
| deeptools | NGS 分析:BAM→bigWig、QC(相关/PCA/指纹)、TSS/峰热图与谱图,适用 ChIP-seq/RNA-seq/ATAC-seq |
| tiledbvcf | TileDB 高效存储与检索基因组变异:VCF/BCF 规模化导入、增量加样、并行查询(群体基因组学) |
| zarr-python | 云端分块 N 维数组(Zarr 3):压缩、并行 I/O、S3/GCS,兼容 NumPy/Dask/Xarray,大型科学计算 |
| polars-bio | Polars 上的高性能基因组区间运算:overlap/nearest/merge/coverage,BED/VCF/BAM/GFF,比 bioframe 更快 |
| pydeseq2 | 批量 RNA-seq 差异表达分析:Wald 检验、FDR 校正、LFC 收缩、结果可视化 |
| bulk-rnaseq | 端到端批量 RNA-seq 编排:FASTQ→QC(FastQC/fastp)→比对定量(STAR/Salmon)→差异表达(pydeseq2)→通路富集→发表级图表,含 nf-core/rnaseq 路线 |
| cellxgene-census |
| 查询 CZ CELLxGENE Census:人口规模级公共单细胞/空间转录组数据、基因表达切片、参考图谱对比 |
| onekgpd | 1000 Genomes 高覆盖队列(3202 人)个体级数据查询 |
| etetoolkit | 系统发育/层次树分析可视化(ETE4):Newick/Nexus I/O、拓扑比较(Robinson-Foulds)、基因树演化事件、NCBI/GTDB 分类 |
| phylogenetics | 系统发育树构建:MAFFT 多序列比对 + IQ-TREE 2 最大似然 + FastTree,适用微生物基因组、病毒谱系动力学、分子钟 |
| waypoint-bio | 微生物组基础模型:Waypoint-6m/45m/170m 检查点,MGnify 539k 样本预训练语料 |
| genomic-coordinates | 基因组坐标转换与变异标准化:BED/GFF/VCF/SAM 等格式互转、0/1-based 校正、indel 左对齐、liftover、GRCh37/hg19/GRCh38/T2T 排查 |
| geniml | 基因组区间模型:Region2Vec、scEmbed 运行规划、BED/universe 契约校验 |
| gtars | 基因组区间模型与集合代数:overlap/count/consensus/coverage、tokenization、Python/Rust/CLI |
| ontology-term-resolution | 自由文本→本体术语 ID 解析(EBI OLS4):UBERON/CL/MONDO/HPO/EFO/ChEBI 等,元数据提交 GEO/ENA/CELLxGENE 前校验 |
| pathogen-variant-surveillance | 病原体变异实时监测(GenSpectrum LAPIS):当前流行谱系、增长优势、突变;SARS-CoV-2/H5N1/流感/RSV/猴痘/麻疹/登革热 |
| genomic-intelligence | 调控基因组学 REST API 查询(gi bearer key) |
| flowio | 流式细胞术数据(FCS 2.0/3.0/3.1)读写与检查:通道元数据、NumPy 事件提取、表格导出(配合 FlowKit 做补偿与门控) |
| lamindb | LaminDB 生物学数据湖:数据集/模型注册、血缘追踪、本体标注(Bionty)、集合/分支/存储与工作流集成 |
| pathway-enrichment | 通路与基因集富集分析:ORA/Enrichr、GSEA、ssGSEA/GSVA,经 gseapy/g:Profiler 覆盖 GO/KEGG/Reactome/WikiPathways/MSigDB,含基因 ID 映射、多重检验校正、富集图与发表级表格 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| rdkit | 化学信息学核心工具箱:SMILES/SDF 解析、描述符(MW/LogP/TPSA)、指纹、子结构搜索、2D/3D 生成、相似性、反应 |
| datamol | RDKit 的 Pythonic 简化封装:SMILES 标准化、描述符、指纹、聚类、3D 构象、并行处理(返回原生 rdkit.Mol) |
| molfeat | 分子特征化(100+ 种):ECFP、MACCS、描述符、ChemBERTa 预训练模型,SMILES→特征,用于 QSAR/分子 ML |
| deepchem | 分子机器学习:ADMET/毒性性质预测(传统 ML 或 GNN)、MoleculeNet 基准、多样化特征化 |
| torchdrug | 分子图深度学习:性质预测、自监督预训练、分子生成、逆合成、蛋白表示学习、知识图谱推理 |
| diffdock | DiffDock/DiffDock-L 分子对接:蛋白-小分子姿态预测(PDB/序列+SMILES)、批量对接、虚拟筛选(不做亲和力预测) |
| molecular-dynamics | 分子动力学模拟:OpenMM 建系、力场、能量最小化与生产 MD,MDAnalysis 分析轨迹(RMSD/RMSF/接触图/自由能面) |
| rowan | 云端计算化学平台(Rowan API):pKa 预测、对接、共折叠等分子模拟工作流(需 API key) |
| medchem | 药物化学过滤器:Lipinski/Veber/CNS 类药规则、PAINS/NIBR/ChEMBL 结构警报、复杂度指标、库筛选查询语言 |
| pytdc | Therapeutics Data Commons 基准:PyTDC 数据集注册、任务切分、评估指标、分子 oracle 工作流 |
| glycoengineering | 蛋白质糖基化分析与工程:N-糖基化(N-X-S/T)位点扫描、O-糖基化热点预测、NetOGlyc/GlycoShield/GlycoWorkbench 工具,抗体优化与疫苗设计 |
| cobrapy | 约束型代谢建模(COBRA):FBA/FVA、基因敲除、通量采样、SBML 模型,系统生物学与代谢工程 |
| primekg | Precision Medicine 知识图谱(PrimeKG):基因、药物、疾病、表型多尺度数据查询 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| esm | ESM3/ESMC 蛋白质语言模型 SDK:Forge/Biohub 推理客户端、ESMFold2 折叠工作流 |
| adaptyv | Adaptyv Bio Foundry API:蛋白质实验设计、提交、结果获取(结合检测/BLI/SPR/热稳定性实验) |
| tamarind | Tamarind Bio 云计算平台:结构预测等计算生物工具(API key 认证) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| pkpd-modeling | 药代/药效动力学建模:NCA、房室/群体 PK、PK/PD 与暴露-反应、TMDD、PBPK、生物等效性(RSABE/ABEL)、异速缩放与首剂人体剂量、DDI 预测(ICH M12)、贝叶斯治疗药物监测 |
| clinical-decision-support | 研究用临床决策支持文档与验证:证据画像、队列、生存、生物标志物/模型、隐私治理(仅限研究用途) |
| clinical-reports | 临床病例/诊断/试验/安全/聚合研究报告草稿:安全边界限定,仅接受合成/去标识化/聚合输入,输出需合格人员复核 |
| treatment-plans | 治疗计划文档格式化与结构验证:临床决策由持证专业人员完成后再文档化,不做临床决策 |
| analytical-method-validation | 分析方法验证:ICH Q2(R2)/Q14、USP 1220/1225/1226、ICH M10 生物分析、CLSI EP、ISO 17025;HPLC/LC-MS/MS/GC/CE/qPCR/NIR 等;线性、精密度、回收率、LOD/LOQ、稳健性、方法转移 |
| iso-standards-readiness | ISO 体系合规证据准备:13485(医疗器械 QMS)、14971(风险管理)、17025(检测校准实验室)、15189(医学实验室) |
| relsa-severity-assessment | 实验动物福利严重度评估与人道终点预测:RELSA 评分 + ARIMA 预测,3Rs/欧盟 2010/63/EU 报告 |
| pyhealth | 临床/医疗深度学习流水线:MIMIC-III/IV、eICU、OMOP 等数据集→任务(死亡率/再入院/住院时长/药物推荐/睡眠分期/ICD 编码)→模型(Transformer/RETAIN/GAMENet 等)→训练→临床指标 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| matplotlib | 底层绘图库:对每个图元精细控制、自定义新图型、PNG/PDF/SVG 发表导出 |
| seaborn | 统计可视化:箱线图、小提琴图、pair plot、热图,与 pandas 集成,快速探索 |
| scientific-visualization | 发表级科学图表:多面板布局、不确定度与缺失数据显示、颜色/对比度审查、期刊导出规划 |
| geomaster | 综合地理空间科学:遥感(Sentinel/Landsat/MODIS/SAR/高光谱)、GIS、空间分析、地学 ML、点云、STAC/COG 云原生、8 种语言 500+ 示例 |
| geopandas | GeoPandas 矢量空间数据:GeoSeries/GeoDataFrame、空间运算、矢量 I/O |
| networkx | 复杂网络/图:最短路径、中心性、聚类、社区检测、随机网络生成、多格式读写、拓扑绘制 |
| dask | 分布式计算:把 pandas/NumPy 代码扩展到超内存/集群,并行文件处理、分布式 ML |
| polars | 高性能 DataFrame:表达式 API、惰性查询优化、并行执行、流式外核、Arrow 互操作、可选 GPU |
| vaex | 十亿行级大数据:out-of-core、惰性求值、快速聚合、大数据可视化与 ML(不占内存) |
| exploratory-data-analysis | 受控探索性数据分析:CSV/TSV/JSON 画像、NumPy/HDF5/FASTA/FASTQ 检视、缺失/泄漏审计、异常值敏感性、EDA 报告脚手架(未知格式拒绝) |
| statistical-analysis | 研究数据统计分析指导:检验选择、假设检验、效应量、功效、贝叶斯替代、APA 报告(t 检验/ANOVA/卡方/相关/回归/非参) |
| statistical-power | 样本量与统计功效:先验功效分析、最小可检测效应、功效曲线、蒙特卡洛模拟功效(逻辑/泊松回归、混合模型、集群随机试验) |
| experimental-design | 实验设计:随机化、区组、分层、对照、因子/部分因子设计、DOE、响应面、交叉/重复测量/裂区、拉丁方、避免混杂 |
| statsmodels | 统计模型库:OLS/GLM/混合模型/ARIMA、残差诊断、计量经济学、严谨推断系数表 |
| pymc | 贝叶斯建模:层次模型、MCMC(NUTS)、变分推断、LOO/WAIC 比较、后验检查 |
| shap | ML 预测解释:SHAP explainer 选择、特征归因计算与验证、多输出解释、局部/全局 SHAP 可视化 |
| umap-learn | 非线性降维:UMAP/DensMAP/AlignedUMAP/参数化 UMAP、2D/3D 嵌入、聚类预处理、监督/半监督 |
| uncertainty-and-units | 物理单位与不确定度:pint 量纲检查、GUM 不确定度预算、A/B 类评估、扩展不确定度、蒙特卡洛传播、CODATA 常数、无量纲组合理性检查 |
| liteparse | 本地文档解析:PDF/DOCX/Office/图片文本提取(带边界框)、扫描件 OCR、RAG 布局 JSON、批量论文摄入、页面渲染 PNG |
| markitdown | 异构文档转 Markdown(Microsoft MarkItDown):Office/PDF/数据格式、批量转换、vision OCR、官方 MCP server |
| simpy | 离散事件仿真:事件、资源、中断、监控、多次重复、预热、可复现输出分析 |
| fluidsim | 计算流体力学仿真:FluidSim 求解器选择、FFT/MPI 配置、数值有效性检查、重启分析(含 HPC 安全检查) |
| openpiv | 粒子图像测速(PIV):从 PIV 图像对提取速度场、互相关窗口、野值替换、涡度/应变率/湍流统计 |
| get-available-resources | 检测主机可用资源:CPU/内存/磁盘/调度器/容器/加速器限额,输出保守的资源规划快照(不做压力测试) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| pytorch-lightning | PyTorch Lightning 框架:LightningModule 组织、Trainer 多 GPU/TPU、DDP/FSDP/DeepSpeed 分布式训练、W&B/TensorBoard/MLflow 日志 |
| transformers | Hugging Face Transformers:Hub 模型加载、pipeline 推理、文本生成、Trainer 微调(NLP/视觉/音频/多模态) |
| stable-baselines3 | 强化学习算法库:PPO/SAC/DQN/TD3/DDPG/A2C,Gymnasium 环境、快速原型 |
| pufferlib | PufferLib RL:环境向量化、策略、PuffeRL 训练与评估、安全 checkpoint 审查(3.0/4.0 版本感知) |
| aeon | 时间序列机器学习:分类/回归/聚类/预测/异常检测/分割/相似搜索,scikit-learn 兼容 API |
| timesfm-forecasting | Google TimesFM 零样本时间序列预测:单变量序列(销售/传感器/能源/生命体征/天气)无需训练,点预测+预测区间 |
| scikit-learn | 经典机器学习:分类/回归/聚类/降维/模型评估/超参调优/流水线 |
| scikit-survival | 生存分析:右删失与竞争风险、防泄漏预处理、模型选择、概率预测、删失感知指标 |
| torch-geometric | 图神经网络:节点/边/图分类、GCN/GAT/GraphSAGE/GIN 消息传递、异质图、邻居采样、自定义数据集 |
| optimize-for-gpu | NVIDIA GPU 加速科学 Python:CUDA 优化、CuPy/cuDF/cuML/cuGraph/cuCIM、Numba-CUDA/RAFT,验证"更快且正确"(官方基准:平均 58 倍加速) |
| pymoo | 多目标优化:NSGA-II/III、MOEA/D、Pareto 前沿、约束处理、ZDT/DTLZ 基准(工程设计) |
| arbor | 自主迭代优化工件:假设树精炼(HTR),在评估器下反复实验优化代码/训练配方/Agent(防过拟合,MLE-bench/Kaggle 式) |
| hypogenic | LLM 辅助假设生成:ChicagoHAI HypoGeniC/HypoRefine,从标注文本数据集生成假设库(HypoBench) |
| modal | Modal 无服务器云平台:云端跑 Python(AI/ML 重点),FaaS 部署与调度 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| paper-lookup | 检索 11 个学术 API:PubMed、PMC、Europe PMC、bioRxiv、medRxiv、arXiv、OpenAlex、Crossref、Semantic Scholar、CORE、Unpaywall(论文/引文/DOI/预印本/开放获取全文) |
| bgpt-paper-search | BGPT MCP 论文检索:全文结构化实验数据,每篇返回 25+ 字段(方法、结果、样本量、质量分、结论) |
| paperclip | Paperclip 全文语料库:约 1100 万篇全文论文 + 21.7 万 FDA/EMA 监管文件,行级定位引用(需 API key) |
| paperzilla | Paperzilla 论文推荐:项目推荐、经典论文详情、Markdown 摘要、订阅 feed |
| literature-review | 系统性文献综述:检索策略、纳入排除标准、证据综合等严谨学术方法 |
| exa-search | Exa 网络研究:网页搜索与内容检索(面向科研的网络情报) |
| parallel-web | Parallel 网络智能:科学主题优先的网络检索与综合 |
| research-lookup | 科研规划与写作的外证据编译(Perplexity 可选) |
| citation-management | 文献引用管理:贯穿研究写作全流程的引文组织 |
| pyzotero | Zotero API v3 Python 封装:文献库读写、条目管理 |
| scientific-writing | 科研手稿撰写/修改/审计:证据溯源、报告指南覆盖、作者责任、保密控制、本地一致性检查 |
| peer-review | 同行评审草稿:方法/统计/可复现性/伦理/图表/引文审查、报告指南选择、修订回应规划 |
| scientific-critical-thinking | 科学主张与证据质量评估:实验设计效度、偏倚与混杂识别、GRADE/Cochrane 偏倚风险分级 |
| scholar-evaluation | 学术成果发展性评审:定性优先、证据可溯源,不做人员排名或高利害决策 |
| hypothesis-generation | 证据有界假设生成:可检验研究问题、候选假设、竞争解释、判别性预测、预注册分析计划 |
| scientific-brainstorming | 证据感知科研头脑风暴:独立生成、结构化讨论、显式假设、透明评估、对抗性评审、决策日志 |
| what-if-oracle | What-If 情景分析:4-6 分支探索(最好/最可能/最坏/黑马/反方/二阶),战略分叉与决策压力测试 |
| consciousness-council | 多视角"心智委员会"思辨:难题/决策/创意挑战的多角度审议、魔鬼代言人分析 |
| dhdna-profiler | 认知模式与思维指纹分析:从文本分析作者的推理模式、决策风格、认知签名 |
| market-research-reports | 可溯源市场研究报告:市场定义、行业证据、竞争格局、TAM/SAM/SOM、预测敏感性、可审计报告脚手架 |
| scientific-slides | 科研演示文稿制作 |
| scientific-schematics | 科研示意图/图解:复杂概念→清晰视觉表达 |
| infographics | 信息图制作:数据/知识可视化叙事 |
| generate-image | AI 图像生成与编辑:经 OpenRouter Image API 调用 Gemini、Seedream 等模型,用于论文配图/封面/示意图 |
| open-notebook | Open Notebook:自托管 NotebookLM 替代品,基于本地语料做研究笔记与问答 |
| latex-posters | LaTeX 科研海报制作 |
| pptx-posters | PowerPoint 科研海报:可编辑、打印/无障碍/溯源/包安全检查 |
| markdown-mermaid-writing | Markdown + Mermaid 写作:24 种图表类型参考、9 种文档模板,文本优先文档标准 |
| venue-templates | 期刊/会议格式模板:官方模板选择、页面/匿名规则、LaTeX 脚手架、投稿 PDF 检查 |
| research-grants | 科研基金申请:NSF/NIH/DOE/DARPA/Taiwan NSTC,机构特定格式、评审标准、预算、影响力陈述 |
| docx | Word 文档:创建/读取/编辑 .docx/.dotx(目录、页眉、批注、图片、查找替换) |
| PDF 处理:读取提取、合并拆分、旋转、水印、表单填写、加解密、图片提取、扫描件 OCR | |
| pptx | PowerPoint:创建/解析/编辑 .pptx/.potx(幻灯片、模板、演讲者备注) |
| xlsx | Excel:创建/编辑 .xlsx/.xlsm/.xltx(公式、格式、财务模型、多表工作簿) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| bids | BIDS 脑成像数据结构标准:神经影像数据组织与元数据规范 |
| neuropixels-analysis | Neuropixels 高密度神经记录分析:大规模电极阵列电生理数据处理 |
| neurokit2 | 生理时间序列:预处理、事件/区间分析、多模态对齐、变异性与复杂度(非诊断用途) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| matchms | 串联质谱(MS/MS)处理:谱文件 I/O、峰过滤、谱相似度、库匹配、分子相似网络 |
| pyopenms | 完整质谱分析平台:特征检测、肽/蛋白鉴定、标记/非标记定量、加合物注释、复杂 LC-MS/MS 流水线 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| pydicom | DICOM 医学影像:读取/检查/写入/转换/脱敏预检(传输语法、压缩插件、帧、私有元素) |
| histolab | 全切片图像(WSI)处理:组织检测、瓦片提取、H&E 染色归一化,轻量流水线 |
| pathml | 计算病理学:幻灯片加载与切片、预处理 QC 流水线、h5path 数据、多路成像定量、空间图构建 |
| deepspot-m | H&E 组织学→虚拟空间转录组(DeepSpot-M):全转录组空间基因表达预测(非商用许可) |
| imaging-data-commons | NCI 癌症影像数据:IDC 集合查询下载、CT/MR/PET/病理 AI 训练集、元数据与许可检查(无需认证) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| astropy | 天文学核心库:单位/量纲、坐标、FITS I/O、表格、时间系统、WCS、宇宙学 |
| pymatgen | 材料结构分析:相图、对称性、电子结构 I/O、Materials Project 有界查询 |
| qiskit | IBM 量子计算:Qiskit 2.x 线路与算子、V2 Sampler/Estimator、目标感知转译、IBM QPU 执行、误差缓解 |
| cirq | Google 量子计算:Google Quantum AI 硬件、噪声感知线路、量子表征实验 |
| pennylane | 量子机器学习:可微线路、VQE/QAOA 变分算法、量子神经网络、PyTorch/JAX 集成、跨硬件移植 |
| qutip | 开放量子系统模拟(QuTiP 5):确定性/轨迹/稳态/光谱/相空间工作流 |
| sympy | 符号数学:代数、微积分、方程求解、符号线性代数、lambdify/LaTeX 代码生成 |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| matlab | MATLAB/GNU Octave 数值工作流:数组、表格/时间数据、测试、项目、图形、MAT 文件、Python 互操作 |
| lab-hardware-cad | 实验室硬件参数化 CAD(build123d):微流控芯片、光机座、比色皿/孔板架、试管架、动物行为装置,导出 STEP/STL/DXF 制造文件 |
(simpy 离散事件仿真、openpiv 流场分析见"数据分析与可视化"类)
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| pylabrobot | PyLabRobot 实验室自动化:液体处理方案、离线仿真、多厂商设备集成(物理执行需人工安全闸门) |
| opentrons-integration | Opentrons 移液机器人:Flex/OT-2 的 Python Protocol API v2 协议编写、仿真、排障(多厂商选 pylabrobot) |
| ginkgo-cloud-lab | Ginkgo Bioworks 云实验室:蛋白表达纯化(无细胞/E.coli/Pichia)、HiBiT/A280 定量、IVT mRNA/circRNA 合成、热稳定性/可开发性实验、SPR 上样 |
| benchling-integration | Benchling 生物研发云平台:注册表实体(DNA/试剂/细胞系等)、实验数据管理 |
| labarchive-integration | LabArchives 电子实验记录本(ELN):REST API 与 Inventory API 集成、签名请求、授权流 |
| dnanexus-integration | DNAnexus 基因组云:dx CLI/dxpy、apps/applets、dxCompiler、Nextflow、数据迁移与执行监控 |
| latchbio-integration | Latch 生物信息云:Python SDK/CLI 构建注册工作流、Nextflow/Snakemake、Latch Data/Registry、运行监控 |
| protocolsio-integration | protocols.io 实验方案库:REST 读取、协议检索 |
| omero-integration | OMERO 生物成像数据管理:OME 文档、图像数据组织(安全传输默认开启) |
| 技能 | 用途 |
|---|---|
| database-lookup | 统一查询 78+ 公共数据库 API:PubChem、ChEMBL、UniProt、PDB、AlphaFold、KEGG、Reactome、STRING、ClinVar、COSMIC、ClinicalTrials.gov、FDA、USPTO、SEC EDGAR 等(带端点/过滤/分页/溯源) |
| depmap | 癌症依赖图谱(DepMap):CRISPR Chronos 基因依赖评分、药物敏感性、基因效应谱(癌基因脆弱性、合成致死、靶点验证) |
| ncats-arax | NCATS Translator 生物医学知识图谱:RTX-KG2 单跳/固定双跳关系查询、Biolink 约束、来源溯源(不做推理/排名/临床建议) |
| hugging-science | Hugging Face 科学资源目录:17 个科学领域的数据集/模型/博客/Spaces,datasets/transformers/Inference API/gradio_client 使用 |
| usfiscaldata | 美国财政部财政数据 API:国债、日/月财政报表、国债拍卖、利率、汇率、储蓄债券、收支统计(无需 key) |
| nextflow | Nextflow/nf-core 流水线:编写/运行/调试可复现科研工作流、DSL2、模块与 nf-test、HPC/SLURM/云执行器 |
| pacsomatic | nf-core/pacsomatic 运维:肿瘤配对变异分析流水线(BAM 输入)、samplesheet 生成、调度器提交与失败排查 |
| autoskill | 自建技能脚手架:基于 screenpipe 守护进程的自动技能创作 |
| pi-agent | Pi 终端编码助手:安装配置、Pi skills/extensions/packages、SDK 嵌入、本地模型路由(llama.cpp)、子代理/ MCP 适配 |